يلعب العلاج بالأوزون، بالإضافة إلى العلاجات الروتينية التي غالباً ما تختلف، دوراً في الجزء التكميلي للقطع. في بعض الأحيان يمكن استخدامه أيضًا للحماية من الآثار الجانبية لطرق العلاج الأخرى (مثل علاجات السرطان).
إذا قمنا بإدراج الأمراض التي تستفيد أكثر من تطبيقات الأوزون: العلاج بالأوزون فعال للغاية في جروح الجلد، وتقرحات الضغط، والحروق، وأقدام مرضى السكري، والتهابات العظام (التهاب العظم والنقي)، وتقرحات الفم، والتعب المزمن، والألم العضلي الليفي والاضطرابات المرتبطة بالتهاب المفاصل، والأوجاع والآلام. ألم الاعتلال العصبي. بالإضافة إلى هذه المجموعة المتنوعة من العلاجات المطبقة في علاجات السرطان، غالبًا ما يُفضل العلاج بالأوزون ويتم النظر إلى فوائده لغرض دعم جهاز المناعة، وتسريع إصلاح وتجديد الأنسجة الطبيعية التالفة، وإزالة الجذور الحرة التي تظهر بعد التغييرات.
كما تستخدم الإجراءات كعلاجات للأمراض المناعية مثل التصلب المتعدد والتهاب المفاصل الروماتويدي وأمراض كرون، بالإضافة إلى الأمراض المزمنة وأمراض الرئة المزمنة والربو والحساسية. يتم تطبيق الأوزون ضمن نطاق العلاج الوقائي لدى الأفراد الأصحاء بسبب خصائصه المضادة للشيخوخة ومضادات الأكسدة.